生鮮食材配送是購銷型的重業務模式，經營業務大多自行采購蔬菜、水果、生鮮等食材配送給企業事業單位、集團、學校等食堂、餐館及酒店。雖然業務給客戶很好的體驗，又融合人脈壁壘，還可逐步衍生后續服務；但是經營中所涉及的稅務處理事宜眾多，繁雜。

食材采購商業環節的稅務問題：1）、農戶個體無發票提供，只能申請代開或由合作社開據發票，也可出據農產品收購發票；2）零星采購的發生，就需定點采購累積后，按賬期匯總由其提供發票；3）小規模納稅人無增值稅專用發票的，到稅務局代開，或使用普通發票但是須依據稅務相關規定進行抵扣，要注意核查，防止稅務條款政策變動。4）對供應商提供的發票要注意在稅務開票系統中查驗其真偽。5）另外，為避免稅務風險，供應商出據發票時需提供供貨清單。6）還有對食材要分清品類，明確食材性質，理清不同的稅率。如：未加工品，加工品稅率是不一樣。

食材配送業在銷售環節的稅務問題：1）節日促銷或客戶大宗采購時，折讓、贈送部分賬務在銷售費用中體現、分攤處理。2）結算時的應收抹零，現金折扣、無發票、退貨多付、零頭補整等要做財務費用或銷售折讓處理，為退貨部分做的折讓，稅務上開紅字發票，沖減收入。3）客戶性質不同，稅率不同，要依據實際情況分別對待。

食配企業在儲存管理環節的稅務問題：1）生鮮配送企業在儲存方面的問題有：存貨不準確，計量不確定，殘存損失統計方法不規范，造成數據難以確認。面對這些問題建立規范的統計方法，做好存貨保鮮，做實數據。2）庫存容易出現負數情況：主要是票據錯誤或延遲、驗貨失誤、進銷規格不一、盤點疏漏、盤點不及時、退貨中形成銷售、殘損未處理、補貨未入庫銷售等。必須規范操作，避免人為失誤；實現系統軟件管理，減少手工操作，還要及時調整處理。3）存貨損失問題：退貨處理不及時，分揀損耗量大。退貨需要及時處理，分揀業務機械化流程化，降低損失比例，盡量杜絕人為損失。4）對蔬菜分揀損失和退貨損失分別核算，前者計成本，后者計營業外支出。這樣處理較為合理。

食材配送環節的稅務問題：1）如果配送司機人員多，司機勞務可由專業勞務派遣公司管理，也可與專業物流配送公司聯營合作，或加強個人的臨時勞務合作，避免一些稅務處理。2）配送過程的臨時補貨，做好銷售預測，提高倉儲和配送水平，定點補貨；倉儲基地補貨。

食配企業運營方面的稅務問題: 1）運營人員工資過高時，以節日、季節補貼等隱形福利發放、多交公積金，公司期權等形式解決；2)公司以農業發展或開發公司形式成立，經營范圍上含農產品自產自銷，獲得稅務優惠。

食材配送行業報稅的稅務問題：1）在報稅時，進項稅合并扣除時，注意負損耗，誤差大問題，通過準確建立基礎數據、計算留痕化解問題；2）及時了解跟蹤稅務政策，財務人員專職處理。

       企業經營過程中的稅務問題雖然繁雜，項目多，只要理清經營的品類，分清項目，由專業的人員就可以輕松處理涉稅問題。